А, вы в принципе…

1. Под MODX2.3 он уже доработан.
2. При установке пакета никакие проекты в нем автоматически не создаются. Это в сборке ShopModxBox уже все настроено, но тянется все за сборкой. А судя по вашему описанию вы все правильно делаете, и вам осталось только указать в пакете нужные вам источники файлов и все.